O tratamento dado ao acervo do MIS é o museológico. Está organizado em sete setores, separados por tipologias: sonoro, textual, audiovisual, iconográfico, partitura, tridimensional e bibliográfico.
O Acervo é formado com 39 coleções particulares de grandes personalidades da nossa cultura. Com mais de 500 mil itens, documentos nos mais variados suportes: fotografias em papel, negativos em vidro, negativos estereoscópicos, cartazes, gravuras, discos, filmes, fitas de vídeo e de áudio (formatos diversos), documentos textuais, partituras e objetos tridimensionais (instrumentos musicais, indumentária, medalhas, troféus, etc.). Este acervo constitui uma significativa parcela da memória carioca. Foi doado ou adquirido de personalidades relacionadas aos diversos setores culturais, com ênfase para a música popular brasileira.